Монастырь Махерас был основан в 1148 году двумя монахами Неофитосом и Игнатием в восточных предгорьях гор Троодос на Кипре, в 25 милях к югу от города Никосия. После смерти Неофитоса, Игнатий, сопровождаемый монахом Прококием, в 1172 году отправился в Константинополь, чтобы просить о финансовой помощи от императора Мануэля I Комненоса. Просьба была удовлетворена и монастырь получил право собственности на всю гору и получил статус ставропигиона, который сделал его независимым от местного епископа, епископа Тамасийского. Монахи построили небольшую церковь, которая в начале тринадцатого века была расширена первым настоятелем монастыря Нейлосом.
После латинского завоевания Кипра и изгнания православных епископов в 1222 году, Папой Гонорием III, монастырь потерял большую часть своей собственности и был доведен до нищеты. В 1571 году турки-османы завоевали Кипр, завершив латинское правление. Однако состояние монастыря не улучшилось до восемнадцатого века до монаха Парфениоса. Османское правление закончилось приобретением Кипра британцами в 1878 году.
Оригинальные монастырские здания были построены в двенадцатом веке. Монастырь был разрушен в огне в 1530 году и перестроен. Монастырский храм был отремонтирован в 1697 году во время правления аббата Леонтия II. Во время греческой войны за независимость турки захватили и продали большую часть имущества монастыря после массовых казней киприотов, в том числе главного духовенства, 9 июля 1821 года, в начале греческой войны за независимость. Существующий монастырь был построен в начале двадцатого века после того, как более ранний был разрушен в результате катастрофического пожара 5 сентября 1892 года.
На сегодняшний день в отреставрированной ризнице находятся кельи монахов, конюшен и складских помещений, а также содержит коллекцию старинных книг и рукописей, икон и других религиозных артефактов.
Братство в монастыре чрезвычайно благочестиво, соблюдая обеты, столь же строгие, как и на горе Афон в Греции.